RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 TFR2Q9UP52 801 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PAPPAQ13219 1627 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MEGF6O75095 1541 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM205CA6NFA0 338 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ASAP2O43150 1006 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ORC4O43929 436 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SERPING1P05155 500 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MYBP10242 640 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ITGA6P23229 1130 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 KIF5BP33176 963 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC63Q05C16 580 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PDE4DQ08499 809 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 NAA25Q14CX7 972 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SEPT2Q15019 361 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 NAB2Q15742 525 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CLUL1Q15846 466 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MIIPQ5JXC2 388 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PDXDC1Q6P996 788 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 USP38Q8NB14 1042 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 TCP11Q8WWU5 503 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CCT6BQ92526 530 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 HVCN1Q96D96 273 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT12Q99456 494 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 TSG101Q99816 390 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 NDST4Q9H3R1 872 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMT1Q9H993 441 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.29□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MYH10P35580 1976 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 RASSF10A6NK89 507 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 COBLO75128 1261 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 RTN2O75298 545 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP6V1G2O95670 118 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM153BP0C7A2 387 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 HSD17B3P37058 310 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 GUCY2FP51841 1108 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM153CQ494X1 144 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC38Q502W7 563 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 BLIDQ8IZY5 108 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC63Q8NA47 563 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 PSMD1Q99460 953 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SH3GL3Q99963 347 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 NOD2Q9HC29 1040 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CEP72Q9P209 647 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.28□□□□□ -1.08
HMBOX1-211ENST00000524238 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC53A6NM62 1247 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 DNM1LO00429 736 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 CYP27B1O15528 508 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 PPIP5K2O43314 1243 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM37O94972 964 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 ANXA13P27216 316 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 CXCR5P32302 372 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 GNAQP50148 359 aa8.27□□□□□ -1.09
HMBOX1-211ENST00000524238 CTSWP56202 376 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms