RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLVS1-209ENST00000522928 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
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CLVS1-209ENST00000522928 A0A1W2PQD8 194 aa5.81□□□□□ -1.48
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CLVS1-209ENST00000522928 PEX11GQ96HA9 241 aa5.77□□□□□ -1.49
CLVS1-209ENST00000522928 SCLYQ96I15 445 aa5.77□□□□□ -1.49
CLVS1-209ENST00000522928 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.77□□□□□ -1.49
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CLVS1-209ENST00000522928 PALD1Q9ULE6 856 aa5.77□□□□□ -1.49
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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