RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518761.8

NPIPB4-204, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-204	ENST00000518761	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NPIPB4-204	ENST00000518761	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	BLACE	A4D250	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	CDC45	O75419	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	CLSTN1	O94985	981 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MPO	P05164	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	GPR85	P60893	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MVK	Q03426	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	LSAMP	Q13449	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TCEA2	Q15560	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	NTRK3	Q16288	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	INF2	Q27J81	1249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ENPP3	O14638	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ABLIM1	O14639	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	PLD2	O14939	933 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	FUCA1	P04066	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	PDE6B	P35913	854 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	NR1I3	Q14994	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	C22orf46	C9J442	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761		H7BY64	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ARNTL	O00327	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ASMTL	O95671	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	LCP1	P13796	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TACR1	P25103	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	BCL6	P41182	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	CEP68	Q76N32	757 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	DPF3	Q92784	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	KCNQ2	O43526	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	CYBB	P04839	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	HSD3B2	P26439	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	GALK1	P51570	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	PAK1	Q13153	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761		Q8N1Y9	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	FEZ1	Q99689	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NPIPB4-204	ENST00000518761	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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