RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	CIITA	P33076	1130 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	SLC39A14	Q15043	492 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	EDIL3	O43854	480 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	TDP2	O95551	362 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	NEMF	O60524	1076 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	NR3C2	P08235	984 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	PTPA	Q15257	358 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	SPTLC2	O15270	562 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	FCGRT	P55899	365 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	SP3	Q02447	781 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	PTGDR	Q13258	359 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	KIF22	Q14807	665 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	DPP9	Q86TI2	863 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	IL31RA	Q8NI17	732 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	MBOAT7	Q96N66	472 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	LAD1	O00515	517 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	ELP1	O95163	1332 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	STAM2	O75886	525 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842		Q4G0T1	1027 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	CEP55	Q53EZ4	464 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	MORN1	Q5T089	497 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	COBL	O75128	1261 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	PPP6R2	O75170	966 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	PRR16	Q569H4	304 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	ASTN1	O14525	1302 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	FAM86B1	E9PN63	330 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	SLC37A4	O43826	429 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	PSMC4	P43686	418 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ME1	P48163	572 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	PDE4D	Q08499	809 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MAP2K5	Q13163	448 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	STXBP2	Q15833	593 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	CALCRL	Q16602	461 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	POTED	Q86YR6	584 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ASB14	A6NK59	587 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	OR52Z1	P0C646	297 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MCM4	P33991	863 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	FGD4	Q96M96	766 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	GPR25	O00155	361 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MEIS1	O00470	390 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MARCH6	O60337	910 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	EDNRB	P24530	442 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	FERMT2	Q96AC1	680 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	MCM3AP	O60318	1980 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	PRPH	P41219	470 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	RGS2	P41220	211 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	JADE2	Q9NQC1	790 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	TBX3	O15119	743 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	NLRX1	Q86UT6	975 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	LENG9	Q96B70	501 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	ITGB5	P18084	799 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	CTGF	P29279	349 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC19-208	ENST00000497842	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		32.27	■■■□□ 2.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms