RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497768.7

TATDN3-204, Transcript of TatD DNase domain containing 3, human

TSL 5

Gene TATDN3, Length 302 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TATDN3-204	ENST00000497768	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	AACS	Q86V21	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768		H3BRJ5	948 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ERC2	O15083	957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	GNA15	P30679	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	MCAM	P43121	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CACNB3	P54284	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	RHBDL3	P58872	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	MECOM	Q03112	1051 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	NFIA	Q12857	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PSMD2	Q13200	908 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PRKG1	Q13976	671 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	GRM2	Q14416	872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768		A0A096LPE4	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	BAG3	O95817	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	EPHA1	P21709	976 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CDC25B	P30305	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	GSTT1	P30711	240 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	BTD	P43251	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ARL4D	P49703	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	RGS3	P49796	1198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	GTF2A2	P52657	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	VGLL4	Q14135	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	IKBKE	Q14164	716 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	TCF12	Q99081	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
TATDN3-204	ENST00000497768	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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