RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	INF2	Q27J81	1249 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	CLEC1B	Q9P126	229 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	CYR61	O00622	381 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	LAMTOR5	O43504	91 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	THBD	P07204	575 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	EPHB4	P54760	987 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	SURF1	Q15526	300 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	TESK1	Q15569	626 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952		X6R8D5	127 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	NLRP10	Q86W26	655 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	USP33	Q8TEY7	942 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	FRS2	Q8WU20	508 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	SHD	Q96IW2	340 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	C22orf46	C9J442	243 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	OVOL3	O00110	214 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	SCRN1	Q12765	414 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	PAK2	Q13177	524 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	CHST13	Q8NET6	341 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	KLC2	Q9H0B6	622 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	AKT3	Q9Y243	479 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC103	Q8IW40	242 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	BVES	Q8NE79	360 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CRBN	Q96SW2	442 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TADA3	O75528	432 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	CAPNS1	P04632	268 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	STAT5A	P42229	794 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	GDF5	P43026	501 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	GJA8	P48165	433 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	KCNH1	O95259	989 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	SCG5	P05408	212 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	COL6A1	P12109	1028 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	FPR2	P25090	351 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	IL13	P35225	146 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	HMGA2	P52926	109 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PPP2CB	P62714	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	PPP2CA	P67775	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	EMC4	Q5J8M3	183 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	IQCE	Q6IPM2	695 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	MRI	Q9BWK5	157 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF536	O15090	1300 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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