RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PNLIPP16233 465 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GRK2P25098 689 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GRK3P35626 688 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX17Q15036 470 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNMB1Q16558 191 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 KIZQ2M2Z5 673 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE1DQ5T752 114 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 BICRALQ6AI39 1079 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NIM1KQ8IY84 436 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTB-211ENST00000489450 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ALG1Q9BT22 464 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CDIP1Q9H305 208 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 IPPKQ9H8X2 491 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ERCC6Q03468 1493 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGGTB-211ENST00000489450 BIN1O00499 593 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NTRK1P04629 796 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GLI1P08151 1106 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-211ENST00000489450 GLI4P10075 376 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGB5P18084 799 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL4AP40617 200 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF460Q14592 562 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ADGRF1Q5T601 910 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8N1Y9 231 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNJ15Q99712 375 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 JAM3Q9BX67 310 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PLAAQ9Y263 795 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 X6R8D5 127 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-211ENST00000489450 SMARCA2P51531 1590 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-211ENST00000489450 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 DBHP09172 617 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE6BP35913 854 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PAK1Q13153 545 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 TM4SF20Q53R12 229 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SRGAP3O43295 1099 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 ASLP04424 464 aa4.7□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 FZD5Q13467 585 aa4.7□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SMARCA4P51532 1647 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 HMGXB3Q12766 1538 aa4.7□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 FAM83GA6ND36 823 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CYBBP04839 570 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 APPP05067 770 aa4.69□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RPTNQ6XPR3 784 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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