RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.05■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 TRIM43BA6NCK2 446 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 DCDC2CA8MYV0 355 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 CCND2P30279 289 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 RUFY3Q7L099 469 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.04■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 A6NJR5 290 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 RGS20O76081 388 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 GH1P01241 217 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 PURAQ00577 322 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 FAAP100Q0VG06 881 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 LY6KQ17RY6 165 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.03■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 KIAA0355O15063 1070 aa26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 ARHGAP1Q07960 439 aa26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 ITGA7Q13683 1181 aa26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 FAM126BQ8IXS8 530 aa26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.02■■□□□ 1.76
STX4-210ENST00000487411 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 GRIN2DO15399 1336 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 MYL3P08590 195 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 EVCP57679 992 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TMEM39AQ9NV64 488 aa26.01■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 KPNA6O60684 536 aa26■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 STAM2O75886 525 aa26■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TBX21Q9UL17 535 aa26■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 V9GY48 417 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 PSMC6P62333 389 aa25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TDHQ8IZJ6 230 aa25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 AFG1LQ8WV93 481 aa25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 BADQ92934 168 aa25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 CD4P01730 458 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 MMP3P08254 477 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TGFB3P10600 412 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 ITGB8P26012 769 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 NAPAP54920 295 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 UBE2SQ16763 222 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 STXBP3O00186 592 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 RAG1P15918 1043 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 LAMC2Q13753 1193 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 GNPTABQ3T906 1256 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 BARHL2Q9NY43 387 aa25.97■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 ICAM3P32942 547 aa25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 ANAPC15P60006 121 aa25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
STX4-210ENST00000487411 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 PPTC7Q8NI37 304 aa25.95■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.95■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 SLC34A2O95436 690 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 GGPS1O95749 300 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 TIMP1P01033 207 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 SCG2P13521 617 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 SP2Q02086 613 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 NTRK3Q16288 839 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.94■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
STX4-210ENST00000487411 FIBPO43427 364 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms