RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	TGM1	P22735	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	POU4F1	Q01851	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SERINC3	Q13530	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	AURKA	O14965	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	KLF4	O43474	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	CD3E	P07766	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	MCM4	P33991	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	GIPR	P48546	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	USP51	Q70EK9	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ITGA1	P56199	1179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	SURF1	Q15526	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CABP7	Q86V35	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PIF1	Q9H611	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	NTRK1	P04629	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	EPHB4	P54760	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	SGSM2	O43147	1006 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	IMPDH2	P12268	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF28	P17035	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PTPN18	Q99952	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	C7orf72	A4D263	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ADAM9	Q13443	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	RAB33A	Q14088	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	VAMP4	O75379	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	ITGA4	P13612	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP2CB	P62714	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP2CA	P67775	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	RASA3	Q14644	834 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208A-208	ENST00000487036	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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