RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 TRPC6Q9Y210 931 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 LCTP09848 1927 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PROB1E7EW31 1015 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PYGBP11216 843 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 BMP3P12645 472 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 STAT3P40763 770 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 KCTD2Q14681 263 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 COL19A1Q14993 1142 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CLUL1Q15846 466 aa7.57□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 GMCL1Q96IK5 515 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 FEM1BQ9UK73 627 aa7.57□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 NMT2O60551 498 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBED4O75132 1171 aa7.56□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 NOVP48745 357 aa7.56□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 HAND2P61296 217 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 FAM160B2Q86V87 743 aa7.56□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 KIFC2Q96AC6 838 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD50Q92878 1312 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 KIF28PB7ZC32 967 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM232C9JQI7 657 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF213O14771 459 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 MBTPS2O43462 519 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PLA2G6O60733 806 aa7.55□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 SMPD1P17405 629 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 MCCP23508 829 aa7.55□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 NT5C2P49902 561 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 OAZ1P54368 228 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ZXDAP98168 799 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CNTN2Q02246 1040 aa7.55□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ARMCX2Q7L311 632 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CPXCR1Q8N123 301 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 ESR2Q92731 530 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 RMDN1Q96DB5 314 aa7.55□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 ASIC4Q96FT7 647 aa7.55□□□□□ -1.2
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 TNKSO95271 1327 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 NEDD4P46934 1319 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 SPEGQ15772 3267 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 PFKMP08237 780 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CHMLP26374 656 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC4A3P48751 1232 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFAIP2Q03169 654 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC96Q2M329 555 aa7.54□□□□□ -1.2
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