RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 ARIH2O95376 493 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 GH1P01241 217 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 TLE2Q04725 743 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 STAM2O75886 525 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 MYL3P08590 195 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 IL31RAQ8NI17 732 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 NID2Q14112 1375 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-209ENST00000484097 ARVCFO00192 962 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 KPNA6O60684 536 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2SQ16763 222 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 GNPTABQ3T906 1256 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 BARHL2Q9NY43 387 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP290O15078 2479 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SMCO2A6NFE2 343 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 STXBP3O00186 592 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 CPLX1O14810 134 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC24BO95487 1268 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TGFB3P10600 412 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SCG2P13521 617 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ADCY7P51828 1080 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGA7Q13683 1181 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TOX2Q96NM4 488 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 A6NJR5 290 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 CLTBP09497 229 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNAR1P17181 557 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK7P50613 346 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 STK3Q13188 491 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMC2Q13753 1193 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD1Q15327 319 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PHKBQ93100 1093 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 RGS20O76081 388 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGAP1Q07960 439 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 NTRK3Q16288 839 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRX1Q86UT6 975 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 AFG1LQ8WV93 481 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMC6P62333 389 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 GDF15Q99988 308 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 PPFIA3O75145 1194 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 GGPS1O95749 300 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 BMP8BP34820 402 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 FAAP100Q0VG06 881 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 C6orf50Q9HD87 102 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 FIBPO43427 364 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 MMP3P08254 477 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4-209ENST00000484097 RAG1P15918 1043 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms