RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483051.5

TTLL3-228, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 4,176 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-228ENST00000483051 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PREBQ9HCU5 417 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DPPA5A6NC42 116 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TEX33O43247 280 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CLCN2P51788 898 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 MTA1Q13330 715 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SLC39A6Q13433 755 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 VPS52Q8N1B4 723 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RETREG2Q8NC44 543 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ECT2Q9H8V3 914 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ERICH2A1L162 156 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 EPS15P42566 896 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ITPK1Q13572 414 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DDX12PQ92771 950 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 FAM81BQ96LP2 452 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 NUP58Q9BVL2 599 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CARD9Q9H257 536 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 EHD2Q9NZN4 543 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 KRT83P78385 493 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ZIM3Q96PE6 472 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 AKAP12Q02952 1782 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 AHCYL1O43865 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SKIP12755 728 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 EPHB4P54760 987 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ICA1Q05084 483 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ERICH1Q86X53 443 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 MICU3Q86XE3 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 GDAP1Q8TB36 358 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TATDN2Q93075 761 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 MEGF6O75095 1541 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 NFAT5O94916 1531 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RPS6KA5O75582 802 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ATICP31939 592 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PPP1R2P41236 205 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TUBB2AQ13885 445 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PARP10Q53GL7 1025 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CHADLQ6NUI6 762 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CCDC80Q76M96 950 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 C14orf80Q86SX3 495 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 EYA3Q99504 573 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 NACA2Q9H009 215 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 IL25Q9H293 177 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 PANK4Q9NVE7 773 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 HACL1Q9UJ83 578 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 ALDH3A1P30838 453 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 DDR1Q08345 913 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 C6orf183Q5T699 404 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 C17orf50Q8WW18 174 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-228ENST00000483051 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms