RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482686.5

PRKCZ-218, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-218ENST00000482686 ARHGAP1Q07960 439 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 ZBTB43O43298 467 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 CD4P01730 458 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 EPHB4P54760 987 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 RTN1Q16799 776 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 AFG1LQ8WV93 481 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 A6NJR5 290 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 SORBS3O60504 671 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 GH1P01241 217 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 CDC27P30260 824 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 APOBRQ0VD83 1088 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 FUT2Q10981 343 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 Q6ZUG5 572 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 MEIS2O14770 477 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 B4GALT4O60513 344 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 MMP3P08254 477 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 CCND2P30279 289 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 SHHQ15465 462 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 BRF1Q92994 677 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PRKCZ-218ENST00000482686 SCN5AQ14524 2016 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 RPS6KB1P23443 525 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 FGD1P98174 961 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 UBE2SQ16763 222 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 TIMP1P01033 207 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 FPGSQ05932 587 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CUL5Q93034 780 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 USP26Q9BXU7 913 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 LAMA3Q16787 3333 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 PIK3CDO00329 1044 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 SP2Q02086 613 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CYP2C18P33260 490 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CHMP4BP1P59074 171 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 SEMA3FQ13275 785 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 NID2Q14112 1375 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 GGPS1O95749 300 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 RCAN1P53805 252 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 MFSD5Q6N075 450 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 KAT2BQ92831 832 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 HIPK3Q9H422 1215 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 SZT2Q5T011 3432 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 KPNA6O60684 536 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 ZNF286BP0CG31 522 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CYP2C9P11712 490 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CSF2RAP15509 400 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 PSMA5P28066 241 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCZ-218ENST00000482686 STXBP3O00186 592 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 NAPAP54920 295 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 LAMC2Q13753 1193 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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