RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-215ENST00000479263 PLS1Q14651 629 aa24.37■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.37■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.37■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 NSMFQ6X4W1 530 aa24.37■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 MTRQ99707 1265 aa24.37■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 RPTORQ8N122 1335 aa24.37■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PLCG1P19174 1290 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 ZNF165P49910 485 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 NLRP12P59046 1061 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 IL31RAQ8NI17 732 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 RAB34Q9BZG1 259 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.36■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 MSH4O15457 936 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 STAT3P40763 770 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 LBX2Q6XYB7 198 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 LUZP1Q86V48 1076 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 BTBD7Q9P203 1132 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.35■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 TBX3O15119 743 aa24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SPATA20Q8TB22 786 aa24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SMARCE1Q969G3 411 aa24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.34■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 UNCXA6NJT0 531 aa24.33■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 DPYDQ12882 1025 aa24.33■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 GRB10Q13322 594 aa24.33■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 CEP55Q53EZ4 464 aa24.33■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.33■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 PNMA5Q96PV4 448 aa24.33■■□□□ 1.49
PRKCZ-215ENST00000479263 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 BMP6P22004 513 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 FKBP1BP68106 108 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 SNAPC2Q13487 334 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 UVSSAQ2YD98 709 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 TKFCQ3LXA3 575 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 FAM20AQ96MK3 541 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CAVIN2O95810 425 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 HERVK_113P62684 666 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 IQCB1Q15051 598 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CALML4Q96GE6 196 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 ACAD9Q9H845 621 aa24.32■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 MEIS1O00470 390 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CUL4BQ13620 913 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 ECM1Q16610 540 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 KRT79Q5XKE5 535 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 MB21D1Q8N884 522 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 RMDN3Q96TC7 470 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 LCTP09848 1927 aa24.31■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 ARP10275 920 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 PXMP2Q9NR77 195 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 VAV3Q9UKW4 847 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CNMDO75829 334 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 SMC2O95347 1197 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 ITGB5P18084 799 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 MORC3Q14149 939 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 PGM5Q15124 567 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CST9Q5W186 159 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.3■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.29■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.29■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.29■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 CUEDC2Q9H467 287 aa24.29■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.29■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.28■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.28■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.28■■□□□ 1.48
PRKCZ-215ENST00000479263 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms