RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478545.1

HIVEP1-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene HIVEP1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-204ENST00000478545 HTTP42858 3142 aa18.52■□□□□ 0.56
HIVEP1-204ENST00000478545 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SEPT4O43236 478 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 MMP1P03956 469 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 KRT2P35908 639 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 PCNX4Q63HM2 1172 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 DEFB118Q96PH6 123 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF3AQ9Y496 699 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.51■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 AKR1A1P14550 325 aa18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CENPFP49454 3210 aa18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 BTBD18B2RXH4 712 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 RGS20O76081 388 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 GJB1P08034 283 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SREBF1P36956 1147 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGAP4P98171 946 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TNFAIP2Q03169 654 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 NR5A1Q13285 461 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 LHX8Q68G74 356 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.49■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 STAM2O75886 525 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SGPL1O95470 568 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SMPD1P17405 629 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF76P36508 570 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TBCKQ8TEA7 893 aa18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 POTEFA5A3E0 1075 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 H3BQV1 296 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ADCY6O43306 1168 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 MSCO60682 206 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CYP3A4P08684 503 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 RARBP10826 455 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 PTGS1P23219 599 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TTLL4Q14679 1199 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.554e-6■■■□□ 19.1
HIVEP1-204ENST00000478545 LY6KQ17RY6 165 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 IFFO2Q5TF58 517 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 NLRX1Q86UT6 975 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CYP2W1Q8TAV3 490 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 SCFD2Q8WU76 684 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa18.47■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 LRRC37A2A6NM11 1700 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 EDIL3O43854 480 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ARIH2O95376 493 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ITGB5P18084 799 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 GJA8P48165 433 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 USP11P51784 963 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 INF2Q27J81 1249 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 COPS5Q92905 334 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 TNFRSF25Q93038 417 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 JADE2Q9NQC1 790 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.46■□□□□ 0.55
HIVEP1-204ENST00000478545 FAM205CA6NFA0 338 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 PGK1P00558 417 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 SEMA3FQ13275 785 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 BECN1Q14457 450 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 GNPTABQ3T906 1256 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 MCTP1Q6DN14 999 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa18.44■□□□□ 0.54
HIVEP1-204ENST00000478545 SORBS3O60504 671 aa18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms