RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 OR6J1Q8NGC5 347 aa29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCG2P13521 617 aa29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 IFNAR1P17181 557 aa29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 AK2P54819 239 aa29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 PKN1Q16512 942 aa29.17■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 LY6KQ17RY6 165 aa29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLC26A6Q9BXS9 759 aa29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 STARD7Q9NQZ5 370 aa29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa29.16■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM60Q495X7 471 aa29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 RIC8AQ9NPQ8 531 aa29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 TPCN1Q9ULQ1 816 aa29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 MRVI1Q9Y6F6 885 aa29.15■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 CXCL17Q6UXB2 119 aa29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 GLT1D1Q96MS3 346 aa29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMCO2A6NFE2 343 aa29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADCY7P51828 1080 aa29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 NEK4P51957 841 aa29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 C1orf53Q5VUE5 145 aa29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.13■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPDYE3A6NKU9 549 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 CPLX1O14810 134 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYN1P17600 705 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCRN1Q12765 414 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD1Q15327 319 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDHA6Q9UN73 950 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ELP1O95163 1332 aa29.12■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZEB2O60315 1214 aa29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 GH1P01241 217 aa29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 CPT1AP50416 773 aa29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGAP1Q07960 439 aa29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 PCNX4Q63HM2 1172 aa29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.11■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 LTBP2Q14767 1821 aa29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 PFKFB2O60825 505 aa29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 VTI1AQ96AJ9 217 aa29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 PGBD1Q96JS3 809 aa29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF2CQ99661 725 aa29.1■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 A6NJR5 290 aa29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 STAM2O75886 525 aa29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 LARGE1O95461 756 aa29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 TLE2Q04725 743 aa29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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ARHGEF3-208ENST00000477440 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMEM260Q9NX78 707 aa29.09■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ESYT2A0FGR8 921 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTS3O15072 1205 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYL3P08590 195 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 PURAQ00577 322 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SP2Q02086 613 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 GNPTABQ3T906 1256 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNV1Q6PIU1 500 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 TEX2Q8IWB9 1127 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 AFG1LQ8WV93 481 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 VPS54Q9P1Q0 977 aa29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SORBS3O60504 671 aa29.07■■■□□ 2.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CABYRO75952 493 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 SEMA3FQ13275 785 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 ME3Q16798 604 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANO3Q9BYT9 981 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 GLT8D2Q9H1C3 349 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLR3EQ9NVU0 708 aa29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 GRIN2DO15399 1336 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 DTNBO60941 627 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 MMP3P08254 477 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 ICAM3P32942 547 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 PSMC6P62333 389 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 EHMT1Q9H9B1 1298 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDLIM7Q9NR12 457 aa29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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