RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476070.1

CERKL-211, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 4

Gene CERKL, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-211ENST00000476070 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 DEFB123Q8N688 67 aa14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.9□□□□□ -0.02
CERKL-211ENST00000476070 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CDC45O75419 566 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CABYRO75952 493 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 NR3C2P08235 984 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CSF2RAP15509 400 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CYP2C18P33260 490 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 FPGSQ05932 587 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MFSD5Q6N075 450 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MAF1Q9H063 256 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 A0A0C4DFX4 3053 aa14.89□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SCN5AQ14524 2016 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MMP3P08254 477 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 ACRP10323 421 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 LIFRP42702 1097 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CPT1AP50416 773 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SP2Q02086 613 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TTLL4Q14679 1199 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 PGM5Q15124 567 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 STXBP2Q15833 593 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 GPR153Q6NV75 609 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CASC1Q6TDU7 716 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 AFG1LQ8WV93 481 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 KAT2BQ92831 832 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TMEM87BQ96K49 555 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 IWS1Q96ST2 819 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MTA3Q9BTC8 594 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 VCANP13611 3396 aa14.88□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SORBS3O60504 671 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CYP2C9P11712 490 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CPA1P15085 419 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 FAM161BQ96MY7 647 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 GUCD1Q96NT3 240 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MAP3K14Q99558 947 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.87□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CCDC69A6NI79 296 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MEIS2O14770 477 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 ZEB2O60315 1214 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SEC24BO95487 1268 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 POLR2MP0CAP2 368 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TMEM240Q5SV17 173 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 RASIP1Q5U651 963 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MICU3Q86XE3 530 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 NEK1Q96PY6 1258 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 GBF1Q92538 1859 aa14.86□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 GH1P01241 217 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 CCL23P55773 120 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 FUT2Q10981 343 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SEMA3FQ13275 785 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 KCNB2Q92953 911 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 SCLYQ96I15 445 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 HIPK3Q9H422 1215 aa14.85□□□□□ -0.03
CERKL-211ENST00000476070 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms