RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITGB8	P26012	769 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLE2	Q04725	743 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGAP1	Q07960	439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEMA3F	Q13275	785 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTLL4	Q14679	1199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	STXBP2	Q15833	593 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKN1	Q16512	942 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPC25	Q9HBM1	224 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCN5A	Q14524	2016 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	LARGE1	O95461	756 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCND2	P30279	289 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAPA	P54920	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SP2	Q02086	613 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAF1	Q13077	416 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK3	Q13188	491 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	GDF15	Q99988	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q9Y3F1	56 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MMP3	P08254	477 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYL3	P08590	195 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANAPC15	P60006	121 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	AFG1L	Q8WV93	481 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELP1	O95163	1332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR81	Q562E7	1941 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959		A6NJR5	290 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959		B4DLN1	442 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	GH1	P01241	217 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLTB	P09497	229 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCG2	P13521	617 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDK7	P50613	346 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	AK2	P54819	239 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAAP100	Q0VG06	881 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CUL5	Q93034	780 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SI	P14410	1827 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARVCF	O00192	962 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	GGPS1	O95749	300 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF286B	P0CG31	522 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNAR1	P17181	557 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPT1A	P50416	773 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADCY7	P51828	1080 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCRN1	Q12765	414 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	KAT2B	Q92831	832 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	AIFM3	Q96NN9	605 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBX21	Q9UL17	535 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP1-208	ENST00000475959	GBF1	Q92538	1859 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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