RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 TLE2Q04725 743 aa22.89■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.89■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SEC24BO95487 1268 aa22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 LY6KQ17RY6 165 aa22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 BARHL2Q9NY43 387 aa22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.88■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 RGS20O76081 388 aa22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 GH1P01241 217 aa22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 A6NJR5 290 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 STXBP3O00186 592 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ARVCFO00192 962 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 STAM2O75886 525 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 NTRK3Q16288 839 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2SQ16763 222 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 IL17RAQ96F46 866 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 TOX2Q96NM4 488 aa22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 MYL3P08590 195 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SCG2P13521 617 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 IFNAR1P17181 557 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 CDK7P50613 346 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP1Q07960 439 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 GNPTABQ3T906 1256 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PHKBQ93100 1093 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 GDF15Q99988 308 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PRO3102Q9H379 93 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.85■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 KPNA6O60684 536 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 CLTBP09497 229 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 TGFB3P10600 412 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ADCY7P51828 1080 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ITGA7Q13683 1181 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 AFG1LQ8WV93 481 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.84■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SMCO2A6NFE2 343 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 LAMC2Q13753 1193 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 PKN1Q16512 942 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 C8orf34Q49A92 452 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.83■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 GRIN2DO15399 1336 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 CPLX1O14810 134 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 PSMC6P62333 389 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 FAAP100Q0VG06 881 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 STK3Q13188 491 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.82■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 PPFIA3O75145 1194 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 MMP3P08254 477 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 ICAM3P32942 547 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 BMP8BP34820 402 aa22.81■■□□□ 1.24
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD1Q15327 319 aa22.81■■□□□ 1.24
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