RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.28□□□□□ -1.88
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SHQ1-204ENST00000468347 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SHQ1-204ENST00000468347 ANKS1AQ92625 1134 aa3.2□□□□□ -1.9
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM209Q96SK2 561 aa3.2□□□□□ -1.9
SHQ1-204ENST00000468347 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.2□□□□□ -1.9
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SHQ1-204ENST00000468347 TLR6Q9Y2C9 796 aa3.2□□□□□ -1.9
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