RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 KCNA10Q16322 511 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 NLRX1Q86UT6 975 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 WASF1Q92558 559 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 ACLYP53396 1101 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 AP3B2Q13367 1082 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 PHKBQ93100 1093 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 CDHR1Q96JP9 859 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 ESYT2A0FGR8 921 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 STXBP3O00186 592 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 PFKFB2O60825 505 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 GH1P01241 217 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 NTRK3Q16288 839 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-209ENST00000462357 ELP1O95163 1332 aa23.58■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 BRCA2P51587 3418 aa23.58■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ST18O60284 1047 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 LAMC2Q13753 1193 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 MAFGO15525 162 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ASGR1P07306 291 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 RABEP1Q15276 862 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 FERMT2Q96AC1 680 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQY0 241 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 NLRP5P59047 1200 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 SCRN1Q12765 414 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 NEDD9Q14511 834 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 GALNT17Q6IS24 598 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 FIBPO43427 364 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.54■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ADCY6O43306 1168 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ZNF76P36508 570 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 PKN1Q16512 942 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 UBE2SQ16763 222 aa23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ICAM3P32942 547 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 BEX3Q00994 111 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 LY6KQ17RY6 165 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 GPRASP2Q96D09 838 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-209ENST00000462357 A6NJR5 290 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 DGKDQ16760 1214 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 GTF3C6Q969F1 213 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 STK36Q9NRP7 1315 aa23.51■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MYL3P08590 195 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MCM2P49736 904 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 RTP1P59025 263 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ME3Q16798 604 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 TOX2Q96NM4 488 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ANO3Q9BYT9 981 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MCM3APO60318 1980 aa23.5■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MYADML2A6NDP7 307 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
IMP4-209ENST00000462357 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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