RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 COPS5Q92905 334 aa23.56■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 PIK3CDO00329 1044 aa23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CPLX1O14810 134 aa23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 ANAPC15P60006 121 aa23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 NKX3-2P78367 333 aa23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.55■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CTAGE5O15320 804 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 ARIH2O95376 493 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CLTBP09497 229 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 ADCY7P51828 1080 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.54■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 ARVCFO00192 962 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 KPNA6O60684 536 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 STAM2O75886 525 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CHMP4BP1P59074 171 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 UBE2SQ16763 222 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 IL31RAQ8NI17 732 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.53■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 LTBP2Q14767 1821 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 MEIS2O14770 477 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 STK3Q13188 491 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 ITGA7Q13683 1181 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 NID2Q14112 1375 aa23.52■■□□□ 1.36
SCAF8-204ENST00000461219 SMCO2A6NFE2 343 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SCG2P13521 617 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 FUT2Q10981 343 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 LAMC2Q13753 1193 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 NLRX1Q86UT6 975 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 AFG1LQ8WV93 481 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PHKBQ93100 1093 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 TOX2Q96NM4 488 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 BARHL2Q9NY43 387 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.51■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 STXBP3O00186 592 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 TGFB3P10600 412 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 RAG1P15918 1043 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PSMC6P62333 389 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD1Q15327 319 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.5■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SORBS3O60504 671 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 EVCP57679 992 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGAP1Q07960 439 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 DGKDQ16760 1214 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 C6orf50Q9HD87 102 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.49■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 A6NJR5 290 aa23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 PPFIA3O75145 1194 aa23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 GGPS1O95749 300 aa23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 GDF15Q99988 308 aa23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 FIBPO43427 364 aa23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 MMP3P08254 477 aa23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 IFNAR1P17181 557 aa23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SCAF8-204ENST00000461219 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.47■■□□□ 1.35
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