RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCA1P28370 1054 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK7P50613 346 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 ACLYP53396 1101 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 NTRK3Q16288 839 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 PKN1Q16512 942 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 RTN1Q16799 776 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 RNF180Q86T96 592 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 TLK2Q86UE8 772 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL16Q8N461 479 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 CALM1P0DP23 149 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 CALM2P0DP24 149 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 MAF1Q9H063 256 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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RABGEF1-206ENST00000461017 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 LARGE1O95461 756 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMA5P28066 241 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-206ENST00000461017 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
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