RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455235.5

ZDHHC3-208, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, human

TSL 4

Gene ZDHHC3, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SCG2	P13521	617 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NAPA	P54920	295 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	COPS5	Q92905	334 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LTBP2	Q14767	1821 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	STAM2	O75886	525 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TRIM60	Q495X7	471 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PHKB	Q93100	1093 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ESYT2	A0FGR8	921 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235		A6NJR5	290 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CABYR	O75952	493 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ARHGAP1	Q07960	439 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	UBE2S	Q16763	222 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZEB2	O60315	1214 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CPT1A	P50416	773 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PRO3102	Q9H379	93 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GH1	P01241	217 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ICAM3	P32942	547 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CDK7	P50613	346 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ADCY7	P51828	1080 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AK2	P54819	239 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ANKRD1	Q15327	319 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LY6K	Q17RY6	165 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TGFB3	P10600	412 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TLE2	Q04725	743 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TOX2	Q96NM4	488 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SMCO2	A6NFE2	343 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PFKFB2	O60825	505 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SCRN1	Q12765	414 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	ARVCF	O00192	962 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SYN1	P17600	705 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AP3B2	Q13367	1082 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	GDF15	Q99988	308 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CPLX1	O14810	134 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FIBP	O43427	364 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KPNA6	O60684	536 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MMP3	P08254	477 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	SP2	Q02086	613 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	STK3	Q13188	491 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	AFG1L	Q8WV93	481 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	KIF2C	Q99661	725 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	PPFIA3	O75145	1194 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	NEK4	P51957	841 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	LAMC2	Q13753	1193 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ZDHHC3-208	ENST00000455235	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		27.72	■■■□□ 2.03

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