RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TBK1Q9UHD2 729 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 BIRC5O15392 142 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 F13A1P00488 732 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CALM1P0DP23 149 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CALM2P0DP24 149 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CALM3P0DP25 149 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PYGMP11217 842 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PLIN5Q00G26 463 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PTK2BQ14289 1009 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD2Q14681 263 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KSR1Q8IVT5 923 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NEK9Q8TD19 979 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PDLIM1O00151 329 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IL32P24001 234 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CENPAP49450 140 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HORMAD1Q86X24 394 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DEPTORQ8TB45 409 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GFPT2O94808 682 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FOSL2P15408 326 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DDIT3P35638 169 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CUL1Q13616 776 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 BBS9Q3SYG4 887 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IRGCQ6NXR0 463 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MDM1Q8TC05 714 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FUT8Q9BYC5 575 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 USP40Q9NVE5 1235 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NACADO15069 1562 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GIPC1O14908 333 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FYNP06241 537 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC16A2P36021 539 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HALP42357 657 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MED21Q13503 144 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 BLMHQ13867 455 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MYBPC3Q14896 1274 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 AGAP3Q96P47 875 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TSKSQ9UJT2 592 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH1L1O75891 902 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 STAT6P42226 847 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 OXCT1P55809 520 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RASA2Q15283 850 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D5Q92609 795 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ECT2Q9H8V3 914 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SYBUQ9NX95 663 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SELENONQ9NZV5 590 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ATP9AO75110 1047 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RGS2P41220 211 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PUDPQ08623 228 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.05□□□□□ -1.44
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