RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AP5M1Q9H0R1 490 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LARGE1O95461 756 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TXNP10599 105 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ME3Q16798 604 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FERMT2Q96AC1 680 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BEX3Q00994 111 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCNA10Q16322 511 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC62Q6P9F0 684 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TEX2Q8IWB9 1127 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPDYE3A6NKU9 549 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RGS20O76081 388 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GNASQ5JWF2 1037 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COPS5Q92905 334 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLT8D2Q9H1C3 349 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHA6Q9UN73 950 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ESYT2A0FGR8 921 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MOXD2PA6NHM9 499 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DEXIO95424 95 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ACLYP53396 1101 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC26Q2I0M4 334 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NECAB1Q8N987 351 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR6J1Q8NGC5 347 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZMYND12Q9H0C1 365 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1W2PQY0 241 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDKL5O76039 1030 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LY6KQ17RY6 165 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCNX4Q63HM2 1172 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GTF3C6Q969F1 213 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VPS54Q9P1Q0 977 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYH7BA7E2Y1 1941 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EVI5O60447 810 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STAM2O75886 525 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ASGR1P07306 291 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLK2P49760 499 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC148Q8NFR7 591 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C6orf50Q9HD87 102 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTDNEP1O95476 244 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XRRA1Q6P2D8 792 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PGBD1Q96JS3 809 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BACH2Q9BYV9 841 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM260Q9NX78 707 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTEL1Q9NZ71 1219 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STK36Q9NRP7 1315 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOSP01100 380 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AP3B2Q13367 1082 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCNV1Q6PIU1 500 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBC1D32Q96NH3 1257 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EHMT1Q9H9B1 1298 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SH3GLB2Q9NR46 395 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAMTS3O15072 1205 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DTNBO60941 627 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GH1P01241 217 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GNA11P29992 359 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RABEP1Q15276 862 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GNPTABQ3T906 1256 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANO3Q9BYT9 981 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZEB2O60315 1214 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CPT1AP50416 773 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGAP1Q07960 439 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNX17Q15036 470 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C7orf61Q8IZ16 206 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLT1D1Q96MS3 346 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AIFM3Q96NN9 605 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STARD7Q9NQZ5 370 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ICAM3P32942 547 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CXCL17Q6UXB2 119 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NR2E3Q9Y5X4 410 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DOCK5Q9H7D0 1870 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TGFB3P10600 412 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTP1P59025 263 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SP2Q02086 613 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ST3GAL1Q11201 340 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1orf53Q5VUE5 145 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ELP1O95163 1332 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A6NJR5 290 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FIBPO43427 364 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NLRP5P59047 1200 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEMA3FQ13275 785 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NLRX1Q86UT6 975 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BICD2Q8TD16 824 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAH12Q6ZR08 3092 aa31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms