RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658		E7EWF7	191 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEMA3E	O15041	775 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT16	P08779	473 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INHBC	P55103	352 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPP3	Q13368	585 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM14	Q14142	442 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASA3	Q14644	834 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MKL1	Q969V6	931 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LY75	O60449	1722 aa		11.51	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658		H0YGN5	161 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCALD	P61601	193 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RARA	P10276	462 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRLR	P16471	622 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEPT2	Q15019	361 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGD4	Q96M96	766 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDN	Q99608	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAFAH1B1	P43034	410 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OPTN	Q96CV9	577 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.5	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF609	O15014	1411 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CPLX1	O14810	134 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBOX5	O94941	541 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASP1	P29466	404 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSD17B3	P37058	310 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSH2	P43246	934 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBXN1	Q04323	297 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF5A	Q12840	1032 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BIRC3	Q13489	604 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITIH4	Q14624	930 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GALNT17	Q6IS24	598 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTR	Q99707	1265 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GGT7	Q9UJ14	662 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMAP	O00193	183 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLC1	Q07866	573 aa		11.49	□□□□□ -0.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPYD	Q12882	1025 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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