RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PKN1Q16512 942 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LY6KQ17RY6 165 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHKBQ93100 1093 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BARHL2Q9NY43 387 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCND2P30279 289 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAPAP54920 295 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELP1O95163 1332 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFNAR1P17181 557 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCG2P13521 617 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TLE2Q04725 743 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP1Q07960 439 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK3Q13188 491 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A6NJR5 290 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZEB2O60315 1214 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPT1AP50416 773 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK7P50613 346 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AK2P54819 239 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIN2DO15399 1336 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMCO2A6NFE2 343 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GH1P01241 217 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SP2Q02086 613 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRDL2Q6WN34 429 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRO3102Q9H379 93 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CABYRO75952 493 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADCY7P51828 1080 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PURAQ00577 322 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AFG1LQ8WV93 481 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARVCFO00192 962 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAMTS3O15072 1205 aa28.67■■■□□ 2.18
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMC6P62333 389 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCRN1Q12765 414 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEMA3FQ13275 785 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAM2O75886 525 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP3P08254 477 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ICAM3P32942 547 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEK4P51957 841 aa28.65■■■□□ 2.18
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAAP100Q0VG06 881 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PGBD1Q96JS3 809 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOX2Q96NM4 488 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GDF15Q99988 308 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM260Q9NX78 707 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ESYT2A0FGR8 921 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SORBS3O60504 671 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFKFB2O60825 505 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TGFB3P10600 412 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGA7Q13683 1181 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD1Q15327 319 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF2CQ99661 725 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPLX1O14810 134 aa28.63■■■□□ 2.17
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