RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 PHKBQ93100 1093 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 STXBP3O00186 592 aa28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 TLE2Q04725 743 aa28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.75■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 NID2Q14112 1375 aa28.75■■■□□ 2.19
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HTATSF1-202ENST00000425695 PKN1Q16512 942 aa28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.71■■■□□ 2.19
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HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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HTATSF1-202ENST00000425695 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.7■■■□□ 2.18
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HTATSF1-202ENST00000425695 PSMC6P62333 389 aa28.7■■■□□ 2.18
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 AFG1LQ8WV93 481 aa28.7■■■□□ 2.18
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HTATSF1-202ENST00000425695 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
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HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS3O15072 1205 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 DTNBO60941 627 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP3P08254 477 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 TGFB3P10600 412 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-202ENST00000425695 FAAP100Q0VG06 881 aa28.64■■■□□ 2.18
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