RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 IQCDQ96DY2 449 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 FAM20AQ96MK3 541 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.55■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 VPS16Q9H269 839 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PIM2Q9P1W9 311 aa22.54■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CLRN2A0PK11 232 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC63Q05C16 580 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 MB21D1Q8N884 522 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 RETREG2Q8NC44 543 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD7Q92527 254 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC175P0C221 793 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 CASP14P31944 242 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 FAM160B2Q86V87 743 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 GINM1Q9NU53 330 aa22.53■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 UBXN1Q04323 297 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 DDX12PQ92771 950 aa22.52■■□□□ 1.2
SUMO3-204ENST00000411651 NUP58Q9BVL2 599 aa22.52■■□□□ 1.2
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SUMO3-204ENST00000411651 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.52■■□□□ 1.2
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SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 ERMNQ8TAM6 284 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 LENG9Q96B70 501 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 ERO1AQ96HE7 468 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 OPLAHO14841 1288 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 CAP2P40123 477 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.51■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 COBLO75128 1261 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 CXCL9Q07325 125 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 FIGNQ5HY92 759 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 KCNK18Q7Z418 384 aa22.5■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.5■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.5■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 ECM1Q16610 540 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.49■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 VEZTQ9HBM0 779 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 FEM1BQ9UK73 627 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.49■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 KIF20AO95235 890 aa22.48■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 TNIP1Q15025 636 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 ACER1Q8TDN7 264 aa22.48■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 DNAJC7Q99615 494 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.48■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.48■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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SUMO3-204ENST00000411651 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.47■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.47■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 DYMQ7RTS9 669 aa22.47■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.47■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 JDP2Q8WYK2 163 aa22.47■■□□□ 1.19
SUMO3-204ENST00000411651 TSG101Q99816 390 aa22.47■■□□□ 1.19
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