RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP1Q07960 439 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 MBTPS1Q14703 1052 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 CHST3Q7LGC8 479 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 ANKS1AQ92625 1134 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 WNT8BQ93098 351 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 INSL6Q9Y581 213 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB14O75071 495 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 GH1P01241 217 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 ALG1Q9BT22 464 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD12-201ENST00000404162 B4DLN1 442 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D5Q92609 795 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH6Q9H252 994 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PSEN2P49810 448 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PTK7Q13308 1070 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf31Q8N865 590 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 ORC4O43929 436 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 LGR5O75473 907 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PDHBP11177 359 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZP2Q05996 745 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 EPC2Q52LR7 807 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 BANK1Q8NDB2 785 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 SNX27Q96L92 541 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 FSD1Q9BTV5 496 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PNMA2Q9UL42 364 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 HIC1Q14526 733 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 DGKDQ16760 1214 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PTPROQ16827 1216 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 USH1GQ495M9 461 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 VPS53Q5VIR6 699 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 HAS3O00219 553 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 AMHP03971 560 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 FGRP09769 529 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 GPM6BQ13491 265 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD10Q14728 455 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 RGS22Q8NE09 1264 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 DCTPP1Q9H773 170 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TOMM22Q9NS69 142 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 COL20A1Q9P218 1284 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 H3BNC9 293 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF543Q08ER8 600 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD11Q96NU1 681 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD12-201ENST00000404162 F2P00734 622 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF286BP0CG31 522 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 IRS1P35568 1242 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 COL19A1Q14993 1142 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 PHOX2BQ99453 314 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 CPVLQ9H3G5 476 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 STXBP2Q15833 593 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM192Q8IY95 271 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 CLDND1Q9NY35 253 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 FAM50BQ9Y247 325 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 SNHG28P0DPA3 235 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 LTBRP36941 435 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms