RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 PLCD1P51178 756 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF131P52739 623 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PHEXP78562 749 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ITGA7Q13683 1181 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC39A14Q15043 492 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 KANK3Q6NY19 840 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 MCM10Q7L590 875 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 STK32AQ8WU08 396 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.3□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A0J9YVX5 310 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RCCD1A6NED2 376 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SERPINB3P29508 390 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 MTTPP55157 894 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ADARP55265 1226 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF844Q08AG5 666 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SPATA1Q5VX52 437 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 GGT6Q6P531 493 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CHST3Q7LGC8 479 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 TAF4BQ92750 862 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 FERMT2Q96AC1 680 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 DYDC2Q96IM9 177 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 MS4A14Q96JA4 679 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 INIPQ9NRY2 104 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 MAGEB3O15480 346 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 NCK2O43639 380 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PBX1P40424 430 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RHBDL3P58872 404 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC39A6Q13433 755 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LSAMPQ13449 338 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SSH3Q8TE77 659 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 NELFBQ8WX92 580 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT12Q99456 494 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PDP2Q9P2J9 529 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ASAP2O43150 1006 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PAEPP09466 180 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 TPBGLP0DKB5 382 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 BCRP11274 1271 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CHN1P15882 459 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 GALK1P51570 392 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RASSF7Q02833 373 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RCN1Q15293 331 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CYP4X1Q8N118 509 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 MREGQ8N565 214 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ERMNQ8TAM6 284 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CATSPER2Q96P56 530 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT23Q9C075 422 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 PNMA2Q9UL42 364 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.29□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 TLDC2A0PJX2 215 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ASLP04424 464 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 UBXN1Q04323 297 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 TIPINQ9BVW5 301 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 CROTQ9UKG9 612 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 HPSEQ9Y251 543 aa9.28□□□□□ -0.92
NHLRC3-201ENST00000379599 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms