RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 SMC5Q8IY18 1101 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 PRR7Q8TB68 274 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CTXN3-201ENST00000379445 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SPTLC1O15269 473 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 ALAS1P13196 640 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 RAG1P15918 1043 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.21□□□□□ -1.1
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CTXN3-201ENST00000379445 PACS2Q86VP3 889 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.21□□□□□ -1.1
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CTXN3-201ENST00000379445 FAM161BQ96MY7 647 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 LNPKQ9C0E8 428 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.21□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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CTXN3-201ENST00000379445 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 ASB14A6NK59 587 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 DLL1O00548 723 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 RECKO95980 971 aa8.2□□□□□ -1.1
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CTXN3-201ENST00000379445 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PTGS1P23219 599 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 FPGSQ05932 587 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC96Q2M329 555 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.2□□□□□ -1.1
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CTXN3-201ENST00000379445 Q6ZNB5 142 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 MORC4Q8TE76 937 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SPC25Q9HBM1 224 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.2□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CTXN3-201ENST00000379445 SNHG28P0DPA3 235 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PDHBP11177 359 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SLC16A2P36021 539 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 HAND2P61296 217 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 BEX3Q00994 111 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TNFAIP2Q03169 654 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 AAMPQ13685 434 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TLK2Q86UE8 772 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TOMM22Q9NS69 142 aa8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 CD4P01730 458 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SMPD1P17405 629 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 SDSP20132 328 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF543Q08ER8 600 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 MFSD5Q6N075 450 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 NSMFQ6X4W1 530 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 VTA1Q9NP79 307 aa8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
CTXN3-201ENST00000379445 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.18□□□□□ -1.1
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