RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF543Q08ER8 600 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGS22Q8NE09 1264 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-204ENST00000373166 LPXNO60711 386 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARIH2O95376 493 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SELPP16109 830 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SESTD1Q86VW0 696 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 AFG1LQ8WV93 481 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GH1P01241 217 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 USH1GQ495M9 461 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAF1Q9H063 256 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 LCHNA4D1U4 455 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMP3P08254 477 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNHG28P0DPA3 235 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPRED2Q7Z698 418 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCN5AQ14524 2016 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPNMBQ14956 572 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 LY6KQ17RY6 165 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAD9AQ99638 391 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SGSM2O43147 1006 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 KDM4AO75164 1064 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CXCL10P02778 98 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFB103AP81534 67 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGAP1Q07960 439 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBL2Q08999 1139 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 DGKDQ16760 1214 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHST3Q7LGC8 479 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 IQCA1Q86XH1 822 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 C7orf31Q8N865 590 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 KAT2BQ92831 832 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT23Q9C075 422 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR37L1O60883 481 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 EFCAB14O75071 495 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJB5O95377 273 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CKBP12277 381 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 STXBP2Q15833 593 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 IWS1Q96ST2 819 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 B4E1Z4 1266 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBNO60934 754 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERVK-21P61565 698 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 IKBKEQ14164 716 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SKAP1Q86WV1 359 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCB11O95342 1321 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTH1RQ03431 593 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D5Q92609 795 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 RMDN3Q96TC7 470 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSEN2P49810 448 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTK7Q13308 1070 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 DGKHQ86XP1 1220 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPVLQ9H3G5 476 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINC01553A4QN01 128 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRDNQ13061 729 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAMC2Q13753 1193 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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