RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC122Q5T0U0 273 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 PODNQ7Z5L7 613 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 MED4Q9NPJ6 270 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.59■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM196BA6NMK8 535 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 PLSCR1O15162 318 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 USP14P54578 494 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 AMPD3Q01432 767 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 MTMR8Q96EF0 704 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 VIPAS39Q9H9C1 493 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM51Q9NW97 253 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 SAR1BQ9Y6B6 198 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB5O15062 677 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC20A2Q08357 652 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 TCP10Q12799 353 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.58■■□□□ 1.85
AMIGO1-201ENST00000369862 RETREG2Q8NC44 543 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP58Q9BVL2 599 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MYMKA6NI61 221 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT86O43790 486 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 APBA3O96018 575 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SV2BQ7L1I2 683 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC102AQ96A19 550 aa26.57■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ENC1O14682 589 aa26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CUL5Q93034 780 aa26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC17Q96LX7 622 aa26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TTYH3Q9C0H2 523 aa26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 STK17AQ9UEE5 414 aa26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 B4DLN1 442 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 PDIA5Q14554 519 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP9Q49MG5 647 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 BICDL2A1A5D9 508 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1328Q86T90 577 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC170Q8IYT3 715 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 HAS1Q92839 578 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 GJA10Q969M2 543 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS6KA5O75582 802 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DACT2Q5SW24 774 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNK18Q7Z418 384 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MMS19Q96T76 1030 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 SLX4Q8IY92 1834 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 IVLP07476 585 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 MRIQ9BWK5 157 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB34Q9BZG1 259 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBED6P86452 979 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 ECM1Q16610 540 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 DYMQ7RTS9 669 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM114A1Q8IWE2 563 aa26.53■■□□□ 1.84
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD54LQ92698 747 aa26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms