RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368602.3

TRAPPC3L-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-202ENST00000368602 COG2Q14746 738 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GRIN2CQ14957 1233 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 HPS1Q92902 700 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MAML3Q96JK9 1138 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MAP3K14Q99558 947 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TTLL1O95922 423 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RASA1P20936 1047 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RPS6KB1P23443 525 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CTHP32929 405 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 HAND2P61296 217 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 BECN1Q14457 450 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ANKS1AQ92625 1134 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 FAM117AQ9C073 453 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NYAP2Q9P242 653 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MAP10Q9P2G4 905 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MYADML2A6NDP7 307 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CLTBP09497 229 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RAG1P15918 1043 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NOVP48745 357 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TFAP4Q01664 338 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 WTAPQ15007 396 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SNX17Q15036 470 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZNF511Q8NB15 262 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MMP19Q99542 508 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GOPCQ9HD26 462 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PNMA2Q9UL42 364 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TTC28Q96AY4 2481 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PARP14Q460N5 1801 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 A0A1W2PQY0 241 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CCDC69A6NI79 296 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 B4E1Z4 1266 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PRC1O43663 620 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 DDAH1O94760 285 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 FCER1AP12319 257 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KIF5BP33176 963 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GNAQP50148 359 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NEK4P51957 841 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 EVCP57679 992 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ICA1Q05084 483 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TRAF1Q13077 416 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SNX21Q969T3 373 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MKL1Q969V6 931 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KAT14Q9H8E8 782 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PHF24Q9UPV7 400 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KIF3AQ9Y496 699 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TNKSO95271 1327 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NEDD4P46934 1319 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 STRNO43815 780 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CDKL5O76039 1030 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ACRP10323 421 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RARBP10826 455 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SMARCA1P28370 1054 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms