RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 CHMP6Q96FZ7 201 aa23.96■■□□□ 1.43
OPN3-201ENST00000366554 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
OPN3-201ENST00000366554 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.96■■□□□ 1.43
OPN3-201ENST00000366554 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.96■■□□□ 1.43
OPN3-201ENST00000366554 ZPR1O75312 459 aa23.96■■□□□ 1.43
OPN3-201ENST00000366554 RWDD2BP57060 319 aa23.96■■□□□ 1.43
OPN3-201ENST00000366554 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.433e-6■□□□□ 10.3
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OPN3-201ENST00000366554 ENO4A6NNW6 628 aa23.93■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 CHD4Q14839 1912 aa23.93■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 ITIH4Q14624 930 aa23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.92■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.91■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.91■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 ASAP2O43150 1006 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 AP1G2O75843 785 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 TMC4Q7Z404 712 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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