RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1W2PPC1 479 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 PIK3CDO00329 1044 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 CLTBP09497 229 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 RUFY3Q7L099 469 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 CUL5Q93034 780 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 NID2Q14112 1375 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 MEIS2O14770 477 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 RGS20O76081 388 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 CCND2P30279 289 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 FAAP100Q0VG06 881 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 LY6KQ17RY6 165 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 SCN5AQ14524 2016 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 A6NJR5 290 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 GH1P01241 217 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 MYL3P08590 195 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGAP1Q07960 439 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGA7Q13683 1181 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 GRIN2DO15399 1336 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA0355O15063 1070 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 PSMC6P62333 389 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-201ENST00000366391 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 LAMA3Q16787 3333 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 EVCP57679 992 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 AFG1LQ8WV93 481 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 BADQ92934 168 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 KPNA6O60684 536 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGB8P26012 769 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE2SQ16763 222 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TBX21Q9UL17 535 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 STAM2O75886 525 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 CD4P01730 458 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 MMP3P08254 477 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 RAG1P15918 1043 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 NAPAP54920 295 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TDHQ8IZJ6 230 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 STXBP3O00186 592 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TGFB3P10600 412 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 LAMC2Q13753 1193 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 GNPTABQ3T906 1256 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 BARHL2Q9NY43 387 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 GBF1Q92538 1859 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 SP2Q02086 613 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 NTRK3Q16288 839 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 SZT2Q5T011 3432 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 GGPS1O95749 300 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 TIMP1P01033 207 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 ICAM3P32942 547 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 ANAPC15P60006 121 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP5-201ENST00000366391 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms