RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PNMA2Q9UL42 364 aa24.36■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 RASEFQ8IZ41 740 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 C7orf31Q8N865 590 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.36■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.33■■□□□ 1.49
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PTPRM-201ENST00000332175 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.32■■□□□ 1.48
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PTPRM-201ENST00000332175 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD16Q68DU8 428 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-201ENST00000332175 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.31■■□□□ 1.48
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