RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 SASH3O75995 380 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2SQ16763 222 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 MCTP2Q6DN12 878 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.75■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 PDE6BP35913 854 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 SCNN1DP51172 638 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 SPA17Q15506 151 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF4Q8WV16 495 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 HAS1Q92839 578 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 HPS3Q969F9 1004 aa21.75■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 USP17L10C9JJH3 530 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 USP11P51784 963 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 PODNQ7Z5L7 613 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC42Q96M95 316 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.74■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 ATP2B2Q01814 1243 aa21.74■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 ST7Q9NRC1 585 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 NYAP2Q9P242 653 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 CRKP46108 304 aa21.73■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 HDXQ7Z353 690 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.73■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 KCTD1Q719H9 257 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.72■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-201ENST00000311008 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 MXD3Q9BW11 206 aa21.71■■□□□ 1.07
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SPNS1-201ENST00000311008 MBOAT7Q96N66 472 aa21.7■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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SPNS1-201ENST00000311008 NFIAQ12857 509 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-201ENST00000311008 STK24Q9Y6E0 443 aa21.7■■□□□ 1.06
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