RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 MMP1P03956 469 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 KRT2P35908 639 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 ANO1Q5XXA6 986 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 OXER1Q8TDS5 423 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 AKR1A1P14550 325 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB118Q96PH6 123 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD4-201ENST00000306324 M0R2N6 131 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 SREBF1P36956 1147 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 MSCO60682 206 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP4P98171 946 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 TNFAIP2Q03169 654 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 NR5A1Q13285 461 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 SCFD2Q8WU76 684 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 BTBD18B2RXH4 712 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 STAM2O75886 525 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 RGS20O76081 388 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 GJB1P08034 283 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 IQSEC1Q6DN90 963 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 H3BQV1 296 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 ADCY6O43306 1168 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 RARBP10826 455 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF76P36508 570 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 GNPTABQ3T906 1256 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 IFFO2Q5TF58 517 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 TBCKQ8TEA7 893 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 BECN1Q14457 450 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL4Q14679 1199 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 LHX8Q68G74 356 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 SGPL1O95470 568 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 SMPD1P17405 629 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 NLRX1Q86UT6 975 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXD4-201ENST00000306324 ARIH2O95376 493 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 ITGB5P18084 799 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 INF2Q27J81 1249 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 TNFRSF25Q93038 417 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 POTEFA5A3E0 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CYP3A4P08684 503 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 PTGS1P23219 599 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 GJA8P48165 433 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 LY6KQ17RY6 165 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 FAM205CA6NFA0 338 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 FIBPO43427 364 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 PDCP20941 246 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SOX10P56693 466 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR1Q13613 665 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CEP55Q53EZ4 464 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 MCTP1Q6DN14 999 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 GPRASP2Q96D09 838 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 JADE2Q9NQC1 790 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 FAM86B1E9PN63 330 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 PGK1P00558 417 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.42■■□□□ 1.66
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