RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LPIN2Q92539 896 aa25.03■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ISCUQ9H1K1 167 aa25.03■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNNC1P63316 161 aa25.02■■□□□ 1.6
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACCSLQ4AC99 568 aa25.02■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPSAP08865 295 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF844Q08AG5 666 aa25.02■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MSL1Q68DK7 614 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.01■■□□□ 1.59
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPHB6O15197 1021 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAD51CO43502 376 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DRD4P21917 467 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMOD1P28289 359 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ECHS1P30084 290 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VWA3BQ502W6 1294 aa25.01■■□□□ 1.59
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIRREL3Q8IZU9 778 aa25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC53A6NM62 1247 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ORC4O43929 436 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRAGAQ7L523 313 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GREM2Q9H772 168 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GSTA1P08263 222 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM59LQ9UK28 342 aa25■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBA7P41226 1012 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC1A4P43007 532 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 INHBEP58166 350 aa24.99■■□□□ 1.59
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TROAPQ12815 778 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ODF2Q5BJF6 829 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.99■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE4DQ08499 809 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDST4Q9H3R1 872 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PALMO75781 387 aa24.98■■□□□ 1.59
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP38Q8NB14 1042 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAP1Q92560 729 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CUEDC2Q9H467 287 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.98■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL33A6NCF5 533 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDAH1O94760 285 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCG2P13521 617 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERVK-9P63128 1117 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SWAP70Q9UH65 585 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALS2Q96Q42 1657 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 F8W031 263 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM37O94972 964 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDXDC1Q6P996 788 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.96■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP2C2O75185 946 aa24.96■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STK4Q13043 487 aa24.96■■□□□ 1.59
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