RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAVIN3Q969G5 261 aa16.17■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLRC1P26715 233 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 COPB2P35606 906 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAF5O00463 557 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 THAP9Q9H5L6 903 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 DISC1Q9NRI5 854 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 H0Y3Z8 333 aa16.16■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.16■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PANK4Q9NVE7 773 aa16.16■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 PXDNQ92626 1479 aa16.16■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-201ENST00000300213 JAG2Q9Y219 1238 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 STK36Q9NRP7 1315 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TECP42680 631 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF5BP33176 963 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERVK-9P63128 1117 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.15■□□□□ 0.18
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PHKG2P15735 406 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHN1P15882 459 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLCG1P19174 1290 aa16.14■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF844Q08AG5 666 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE3CQ15386 1083 aa16.14■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 WLSQ5T9L3 541 aa16.14■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A8MUI8 341 aa16.14■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CCNE1P24864 410 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 TXKP42681 527 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 MXRA7P84157 204 aa16.14■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMD1Q99460 953 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTI1O43156 1089 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCAMP50895 628 aa16.13■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 RETREG2Q8NC44 543 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH3GL3Q99963 347 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 DRP2Q13474 957 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-201ENST00000300213 VWA3BQ502W6 1294 aa16.13■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-201ENST00000300213 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
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