RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SLFN14P0C7P3 912 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 RSPH3Q86UC2 560 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PBKQ96KB5 322 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF14Q9UBS8 474 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM133AQ8N9E0 248 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR108Q9NPR9 543 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANAPC5Q9UJX4 755 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP1P03956 469 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM232C9JQI7 657 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC4O95801 387 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GREM2Q9H772 168 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM42Q8IWZ5 723 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 STK17AQ9UEE5 414 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R5AQ15172 486 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 NIM1KQ8IY84 436 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 THEGQ9P2T0 379 aa26.25■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GPC4O75487 556 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 OATP04181 439 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 BAG5Q9UL15 447 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GAP43P17677 238 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP9Q9H5L6 903 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP2B4P23634 1241 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SMYD2Q9NRG4 433 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TMOD1P28289 359 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SCNN1DP51172 638 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL29Q96CT2 875 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC68Q9H2F9 335 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa26.24■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PANX2Q96RD6 677 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIP5K2O43314 1243 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE8BO95263 885 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPSAP1Q14558 356 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ALS2CLQ60I27 953 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 DISC1Q9NRI5 854 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 MSH2P43246 934 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 COX16Q9P0S2 106 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8OA6NCC3 632 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8NF8WBI6 632 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPH1Q70E73 1250 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.23■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PFDN6O15212 129 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 MX2P20592 715 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP8Q14790 479 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCB4Q15147 1175 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCB6Q9NP58 842 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL1P05976 194 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFA10O95299 355 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 BANK1Q8NDB2 785 aa26.22■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SLCO1A2P46721 670 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 RESTQ13127 1097 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBED6P86452 979 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 WHAMMQ8TF30 809 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 PAGR1Q9BTK6 254 aa26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRN2O75325 713 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms