RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 COPS5Q92905 334 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.71■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.7■■■□□ 2.19
CXCL2-201ENST00000296031 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD1Q15327 319 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.7■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SCG2P13521 617 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 LY6KQ17RY6 165 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 ZEB2O60315 1214 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 RGS20O76081 388 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 NEK4P51957 841 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 AK2P54819 239 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SNX17Q15036 470 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 PKN1Q16512 942 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM60Q495X7 471 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 C1orf53Q5VUE5 145 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.68■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SMCO2A6NFE2 343 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 CPLX1O14810 134 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 ADCY7P51828 1080 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 ELP1O95163 1332 aa28.67■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SYN1P17600 705 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 CPT1AP50416 773 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 STAM2O75886 525 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 GH1P01241 217 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.65■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 CABYRO75952 493 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.64■■■□□ 2.18
CXCL2-201ENST00000296031 A6NJR5 290 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PFKFB2O60825 505 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 SCRN1Q12765 414 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 GNPTABQ3T906 1256 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.63■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 MYL3P08590 195 aa28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 TGFB3P10600 412 aa28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 TLE2Q04725 743 aa28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP1Q07960 439 aa28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.62■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ESYT2A0FGR8 921 aa28.61■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 AFG1LQ8WV93 481 aa28.61■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PGBD1Q96JS3 809 aa28.61■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 C6orf50Q9HD87 102 aa28.61■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.61■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 SORBS3O60504 671 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 CDKL5O76039 1030 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 LAMC2Q13753 1193 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 KIF2CQ99661 725 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM260Q9NX78 707 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.6■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ARVCFO00192 962 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 KPNA6O60684 536 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 DEXIO95424 95 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 ICAM3P32942 547 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 CDK7P50613 346 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PSMC6P62333 389 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 PURAQ00577 322 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 SP2Q02086 613 aa28.59■■■□□ 2.17
CXCL2-201ENST00000296031 AP3B2Q13367 1082 aa28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms