RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259008.6

BRIP1-201, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIP1, Length 6,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-201ENST00000259008 STAM2O75886 525 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MYBP10242 640 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PPP1R2P41236 205 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SCYL3Q8IZE3 742 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GSDMBQ8TAX9 411 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 IFNKQ9P0W0 207 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CLIC2O15247 247 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 STK10O94804 968 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PTPREP23469 700 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TYRO3Q06418 890 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 KRT81Q14533 505 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GNASQ5JWF2 1037 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TCP11Q8WWU5 503 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 AK9Q5TCS8 1911 aa7□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 YAF2Q8IY57 180 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SYT17Q9BSW7 474 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 EFCC1Q9HA90 598 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PDHXO00330 501 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 FERP16591 822 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 JAK3P52333 1124 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 LRRC41Q15345 812 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TRIM50Q86XT4 487 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TTC14Q96N46 770 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 A0A087WWV3 80 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 GNG11P61952 73 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CLIC4Q9Y696 253 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ENTPD3O75355 529 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PEX3P56589 373 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 KIF5AQ12840 1032 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MYO1EQ12965 1108 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ATL3Q6DD88 541 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ACCSQ96QU6 501 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MTRQ99707 1265 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 ATP8B3O60423 1300 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TACC1O75410 805 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CDC25AP30304 524 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SNX21Q969T3 373 aa6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CD58P19256 250 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PHKA2P46019 1235 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 NR5A1Q13285 461 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CCDC25Q86WR0 208 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 A0A1W2PRG0 241 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 SLC4A1P02730 911 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 TNFAIP2Q03169 654 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 CCDC14Q49A88 953 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.98□□□□□ -1.29
BRIP1-201ENST00000259008 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms