RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SKAP1Q86WV1 359 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 RSAD1Q9HA92 442 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 GGA1Q9UJY5 639 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CFAP69A5D8W1 941 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 KLHL33A6NCF5 533 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 DLL1O00548 723 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ZBED1O96006 694 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SETSIPP0DME0 302 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LCP1P13796 627 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 AKAP5P24588 427 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SCAND1P57086 179 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 TEX19Q8NA77 164 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 INVSQ9Y283 1065 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SCINQ9Y6U3 715 aa7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CCDC66A2RUB6 948 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 STXBP3O00186 592 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LILRB5O75023 590 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MAN1A1P33908 653 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LONRF1Q17RB8 773 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 TNIP3Q96KP6 325 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MYD88Q99836 296 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.48□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MEGF11A6BM72 1044 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SLC26A4O43511 780 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SLITRK5O94991 958 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 HRGP04196 525 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MYBP10242 640 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ALAS2P22557 587 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LTBRP36941 435 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 PHC1P78364 1004 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SV2AQ7L0J3 742 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 RASSF3Q86WH2 238 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 JADE3Q92613 823 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ORAI2Q96SN7 254 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 RNF38Q9H0F5 515 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.47□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 AURKAO14965 403 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 PPFIA3O75145 1194 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LRRN2O75325 713 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 OFD1O75665 1012 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 DGAT1O75907 488 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 WISP1O95388 367 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 LILRA6Q6PI73 481 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CDH24Q86UP0 819 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 POF1BQ8WVV4 589 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 MIPEPQ99797 713 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 ALG1Q9BT22 464 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 CBLCQ9ULV8 474 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 RNF112Q9ULX5 631 aa7.46□□□□□ -1.21
MDM2-201ENST00000258148 M0R082 166 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 ST8SIA5O15466 376 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 SIGLEC6O43699 453 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 CTSKP43235 329 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 MAP2K3P46734 347 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 DNM2P50570 870 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 GTF2A2P52657 109 aa7.46□□□□□ -1.22
MDM2-201ENST00000258148 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms