RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP2C2O75185 946 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 PALMO75781 387 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 EHHADHQ08426 723 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 VWA3BQ502W6 1294 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 STX8Q9UNK0 236 aa23.49■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 DOCK2Q92608 1830 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXKP42681 527 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFT88Q13099 833 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAA35Q5VZE5 725 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.48■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA0754O94854 1291 aa23.47■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 CALML3P27482 149 aa23.47■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.47■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHADLQ6NUI6 762 aa23.47■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 EMBQ6PCB8 327 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM260Q9NX78 707 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAF1P21675 1872 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYMKA6NI61 221 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 POTEDQ86YR6 584 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 RETREG2Q8NC44 543 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP21Q9UK80 565 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 BICDL2A1A5D9 508 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 NR1D1P20393 614 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 FNTAP49354 379 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 BAP1Q92560 729 aa23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CSNK1G2-201ENST00000255641 E7EVH7 732 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 M0R2N6 131 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 GBP6Q6ZN66 633 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 YY1AP1Q9H869 796 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLRC1P26715 233 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERFEQ4G0M1 354 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQCKQ8N0W5 287 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLR2O60603 784 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMOD1P28289 359 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 SKOR1P84550 965 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 POTEMA6NI47 508 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 STXBP3O00186 592 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAD51CO43502 376 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALS2CLQ60I27 953 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 BARGINQ6ZT62 677 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOX5Q96PH1 765 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLAAQ9Y263 795 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR52Z1P0C646 297 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF5BP33176 963 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAPAP54920 295 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNK18Q7Z418 384 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAVIN3Q969G5 261 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGRP09769 529 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNMA1Q12791 1236 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 HGSNATQ68CP4 663 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFT20Q8IY31 132 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNPY4Q8N129 248 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 TBC1D5Q92609 795 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PQJ5 194 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 NTSR2O95665 410 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTGISQ16647 500 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1G2-201ENST00000255641 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms