RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Celf3Q8CIN6 465 aa24.41■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trpv6Q91WD2 767 aa24.41■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PrelpQ9JK53 378 aa24.41■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa24.41■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep290Q6A078 2472 aa24.41■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Irgm2A0A140LIF8 407 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gucy1a2F8VQK3 730 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Galnt17Q7TT15 598 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bmp3Q8BHE5 468 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fermt2Q8CIB5 680 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gpr108Q91WD0 569 aa24.4■■□□□ 1.5
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rassf3Q99P51 232 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Galntl5Q9D4M9 431 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cnpy3Q9DAU1 276 aa24.4■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TriobpQ99KW3 2014 aa24.39■■□□□ 1.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pgap3A2A559 320 aa24.39■■□□□ 1.49
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ScapQ6GQT6 1276 aa24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tas1r1Q99PG6 842 aa24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm4758L7N258 96 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ZbbxQ0P5X5 716 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dis3lQ8C0S1 1053 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Havcr2Q8VIM0 281 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CenppQ9CZ92 286 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pus10Q9D3U0 527 aa24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ank3G5E8K5 1961 aa24.37■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm4788E9Q8B5 879 aa24.37■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 EdnrbP48302 442 aa24.37■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rnf207Q3V3A7 635 aa24.37■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grin3bQ91ZU9 1003 aa24.37■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cul5Q9D5V5 780 aa24.37■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eif4e3Q9DBB5 207 aa24.37■■□□□ 1.49
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 P01645 108 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 P01646 108 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 P01647 108 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kcnn2P58390 839 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Carmil2Q3V3V9 1296 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rnf20Q5DTM8 973 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm11487Q5RIS0 354 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Triml1Q8BVP1 470 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ClmnQ8C5W0 1052 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdan1Q8CC12 1239 aa24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atad5Q4QY64 1826 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmem131O70472 1877 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dhtkd1A2ATU0 921 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Itgb5O70309 798 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RabggtbP53612 339 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cnnm3Q32NY4 713 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 DymQ8CHY3 669 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adcy3Q8VHH7 1145 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmco4Q91WU4 631 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atg13Q91YI1 516 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ttc9bQ9D6E4 239 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hmg20bQ9Z104 317 aa24.35■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnai2A2AC93 623 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 DgkhD3YXJ0 1156 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map7O88735 730 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sox1P53783 391 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Meis2P97367 477 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrrc55Q3UY51 311 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Casc1Q6TDU8 730 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Agbl3Q8CDP0 1006 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prrg2Q8R182 198 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Susd3Q9D176 269 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Acox2Q9QXD1 681 aa24.34■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MthfslL7N466 203 aa24.33■■□□□ 1.49
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc5a4aQ9ET37 656 aa24.33■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gpaa1Q9WTK3 621 aa24.33■■□□□ 1.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm7086A0A1W2P766 342 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 A0A1Y7VML8 143 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tdo2P48776 406 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 March9Q3TZ87 348 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Crtc1Q68ED7 630 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm21985Q6P6P5 1106 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dalrd3Q6PJN8 538 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neu4Q8BZL1 478 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Oit3Q8R4V5 546 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adam33Q923W9 797 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 FibpQ9JI19 357 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stk39Q9Z1W9 556 aa24.32■■□□□ 1.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa24.31■■□□□ 1.48
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