RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NFS1	Q9Y697	457 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	AKR1B10	O60218	316 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ATP2C2	O75185	946 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NEBL	O76041	1014 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ERCC3	P19447	782 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SLC1A4	P43007	532 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SCTR	P47872	440 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ACCSL	Q4AC99	568 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LRRC53	A6NM62	1247 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FCER1A	P12319	257 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ECHS1	P30084	290 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MAGEA1	P43355	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PJA2	O43164	708 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RAD51C	O43502	376 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FTCD	O95954	541 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HSD17B3	P37058	310 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MAP3K12	Q12852	859 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CRYM	Q14894	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	P2RX5	Q93086	422 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CCNE1	P24864	410 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	XRCC4	Q13426	336 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HLF	Q16534	295 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MTA3	Q9BTC8	594 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ALS2	Q96Q42	1657 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MGRN1	O60291	552 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NLRP5	P59047	1200 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PALM	O75781	387 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FLT3	P36888	993 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	EVX2	Q03828	476 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CCT6B	Q92526	530 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	BAP1	Q92560	729 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NOX5	Q96PH1	765 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78

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